Le Scuole Italiane in Slovenia sono pienamente inserite nell'ordinamento scolastico di quel Paese.
Si inizia con la Scuola Materna per approdare quindi alla Scuola Elementare o dell'Obbligo che dura nove anni suddivisi in tre cicli triennali. Questa Scuola ingloba quella che in Italia è la Scuola Media.
Al termine di questo ciclo di studi lo studente approda alle Superiori. Nel caso delle Scuola Italiane vi sono due Licei, uno a Capodistria e uno a Pirano, mentre a Isola è presente un Istituto Professionale che forma Segretari d'Azienda (3+2 anni), Meccanici con vari indirizzi (3 anni) e Tecnici in Economia, il Ragioniere italiano, (4 anni).

Le scuole Italiane seguono i programmi ministeriali sloveni dai quali si discostano per delle specificità:

- La lingua esclusiva d'insegnamento è l'Italiano
- Lo Sloveno viene studiato come lingua "d'ambiente"
- Viene quindi, come nelle altre scuole slovene, studiato l'inglese come lingua straniera

La Storia e la Geografia sono integrate con argomenti specifici riguardanti le analoghe materie italiane; sono ugualmente integrate con riferimenti alla cultura italiana altre materie con connotati nazionali come la Musica, la Storia dell'Arte, ecc.

Le Scuole Italiane della Slovenia partecipano ai contributi che lo Stato Italiano versa alla Comunità Italiana. Questi contributi in genere sono utilizzati per l'acquisto di materiale didattico, per l'organizzazione di corsi e seminari di aggiornamento per gli insegnanti, per l'acquisto di libri di testo, ecc. Talvolta lo Stato Italiano interviene con contributi straordinari per la l'edilizia scolastica.